中國(guó)科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所（簡(jiǎn)稱上海有機(jī)所）是集基礎(chǔ)研究、應(yīng)用研究和高技術(shù)創(chuàng)新研究為一體的綜合性化學(xué)研究機(jī)構(gòu)，創(chuàng)建于1950年5月，是中國(guó)科學(xué)院首批成立的15個(gè)研究所之一，前身是建立于1928年7月的前中央研究院化學(xué)研究所。從開(kāi)展抗生素和高分子化學(xué)的研究起步，經(jīng)過(guò)70年幾代人艱苦創(chuàng)業(yè)、奮力拼搏，在以有機(jī)化學(xué)研究為中心的基礎(chǔ)研究、應(yīng)用研究與高新技術(shù)開(kāi)發(fā)、人才培養(yǎng)等方面均取得令人矚目的成就。在我國(guó)“兩彈一星”研制、“人工合成牛胰島素、人工合成酵母丙氨酸轉(zhuǎn)移核糖核酸”和“物理有機(jī)化學(xué)中的兩個(gè)基本問(wèn)題：自由基化學(xué)中取代基離域參數(shù)和有機(jī)分子簇集概念”等一批攀登科技高峰的重要成果中，我所科研人員作出了重要貢獻(xiàn)。
根據(jù)中科院新時(shí)期“三個(gè)面向，四個(gè)率先”辦院方針要求，上海有機(jī)所戰(zhàn)略定位為：立足基礎(chǔ)交叉前沿領(lǐng)域，堅(jiān)持重大科學(xué)問(wèn)題和國(guó)家重大需求導(dǎo)向，發(fā)揮有機(jī)合成化學(xué)的創(chuàng)造性，加強(qiáng)與生命科學(xué)、材料科學(xué)的交叉與融合；致力于推動(dòng)我國(guó)化學(xué)轉(zhuǎn)化方法學(xué)、化學(xué)生物學(xué)、有機(jī)新材料創(chuàng)制科學(xué)等重點(diǎn)學(xué)科領(lǐng)域的發(fā)展；在有機(jī)化學(xué)基礎(chǔ)研究、新醫(yī)藥農(nóng)藥和高性能有機(jī)材料創(chuàng)制方面實(shí)現(xiàn)新的突破；引領(lǐng)有機(jī)化學(xué)學(xué)科前沿的發(fā)展，滿足國(guó)家戰(zhàn)略需求，服務(wù)國(guó)民經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場(chǎng)；將上海有機(jī)所建設(shè)成為國(guó)際一流的有機(jī)化學(xué)研究中心。
在此定位下，上海有機(jī)所努力實(shí)現(xiàn)三個(gè)方面的重大突破，即高性能聚烯烴材料制備的關(guān)鍵科學(xué)、技術(shù)與應(yīng)用；化學(xué)理念指導(dǎo)的菌種改造和微生態(tài)系統(tǒng)構(gòu)建的集成性研究與應(yīng)用；高性能有機(jī)氟材料的關(guān)鍵科學(xué)、技術(shù)與應(yīng)用。在實(shí)現(xiàn)三個(gè)方面的重大突破的同時(shí)，重點(diǎn)培育五個(gè)學(xué)科發(fā)展方向與發(fā)展領(lǐng)域：導(dǎo)向綠色合成的新一代催化轉(zhuǎn)化；導(dǎo)向藥物發(fā)現(xiàn)的復(fù)雜天然產(chǎn)物全合成和系統(tǒng)化學(xué)生物學(xué)研究；重要醫(yī)藥、農(nóng)藥的核心制備科學(xué)、技術(shù)與應(yīng)用；高性能有機(jī)功能材料的結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)、合成與應(yīng)用；含能及推進(jìn)劑關(guān)鍵材料的研究與開(kāi)發(fā)。
上海有機(jī)所現(xiàn)有2個(gè)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、4個(gè)院重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，分別為：生命有機(jī)化學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、金屬有機(jī)化學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、中國(guó)科學(xué)院有機(jī)氟化學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、中國(guó)科學(xué)院天然產(chǎn)物有機(jī)合成化學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、中國(guó)科學(xué)院有機(jī)功能分子合成與組裝化學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和中國(guó)科學(xué)院能量調(diào)控材料重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。此外，還有同國(guó)內(nèi)外大學(xué)、企業(yè)聯(lián)合共建的，如滬港化學(xué)合成聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室、寧波新材料創(chuàng)制中心等多個(gè)聯(lián)合研究中心。
截止2020年底，上海有機(jī)所共獲得各種科研成果獎(jiǎng)363項(xiàng)，包括國(guó)家三大獎(jiǎng)75項(xiàng)，其中國(guó)家自然科學(xué)一等獎(jiǎng)3項(xiàng)（其中2項(xiàng)為合作）、二等獎(jiǎng)20項(xiàng)（其中1項(xiàng)為合作）；國(guó)家創(chuàng)造發(fā)明獎(jiǎng)3項(xiàng)和國(guó)家發(fā)明二等獎(jiǎng)4項(xiàng)（其中3項(xiàng)為合作）；國(guó)家科技進(jìn)步獎(jiǎng)特等獎(jiǎng)3項(xiàng)（合作），一等獎(jiǎng)1項(xiàng)（合作），二等獎(jiǎng)12項(xiàng)（其中6項(xiàng)為合作）；獲得包括中國(guó)科學(xué)院自然科學(xué)一等獎(jiǎng)28項(xiàng)在內(nèi)的中國(guó)科學(xué)院各類獎(jiǎng)145項(xiàng)；上海市科技成果獎(jiǎng)92項(xiàng)。共獲授權(quán)專利1028項(xiàng)（其中國(guó)外專利49項(xiàng)），發(fā)表學(xué)術(shù)論文12319余篇。共有在職職工695人。包括中國(guó)科學(xué)院院士8人、研究員及正高級(jí)工程技術(shù)人員93人、副研究員及高級(jí)技術(shù)人員193人。在學(xué)研究生672人。在站博士后60人。
受中國(guó)化學(xué)會(huì)委托，上海有機(jī)所負(fù)責(zé)編輯出版《有機(jī)化學(xué)》、《化學(xué)學(xué)報(bào)》和《中國(guó)化學(xué)》（英文版）
